对 SI 应坚持防重于治的原则，但因 SIV 亚型众多，依靠少数几个亚型的疫苗往往不能凑效，目前兽医多采取一般性的卫生措施和精细的饲养管理预防本病。
（1）免疫接种
目前，市场上的疫苗主要是含H1N1 和 H3N2 的灭活疫苗和亚单位疫苗，我国至今没有商品化的 SI 疫苗。
（2）隔离与消毒
做好发病猪、易感猪与健康猪的隔离，淘汰发病较重的猪只，病死猪深埋处理。全场地面及器具用 2% 的 NaOH水溶液彻底消毒，防止易感动物和感染动物的接触。保证猪栏清洁、干燥和保暖。对铺垫干草经常进行更换，为猪群提供较为舒适的生活环境。
（3）减少应激
密切注意天气变化，及时取暖保温，避免应激导致的抵抗力下降而发病。在冬春季节和寒风侵袭、冷雨浸淋等气温变化大时，及时做好保温工作，正确协调保温与通风换气的关系。做好猪舍温湿度控制，确保空气新鲜，猪舍卫生清洁，尽量为猪只营造安逸、舒适的生活，减少养殖过程中的应激反应，维持猪群正常的免疫应答反应。
（4）精心的饲养管理
饲喂全价均衡的饲料，饲料中应含有优质足量的维生素、氨基酸和平衡的微量元素，以及比例适宜的能量和粗蛋白质以提高猪只的抵抗力。防止饲料霉变，同时提供清洁饮水。换料、转群、饲喂、清扫等每一个环节都要做到精细管理。每天对猪群进行巡视，发现异常及时解决或上报求助。
（5）适时保健
每月定期或遇到天气变化时，在饲料或饮水中添加治疗剂量的药物（敏感抗生素或天然中草药），连续使用 7 天，以减少、控制体内病原微生物的早期感染。
