我国生猪生产相对落后，目前仍存在大量小规模、分散饲养的养殖户。生猪生产技术服务体系不健全问题尤为突出，良种繁育体系不够完善，基层畜牧兽医队伍不稳定，检测设备和手段落后，导致防疫不力和兽药滥用。专业合作组织规模较小，实力薄弱，组织协调力不强，市场风险仍不易规避，影响生猪生产的稳定发展。
生猪价格波动风险加大
近年来生猪价格波动剧烈，2006年5月至2008年4月，全国生猪价格由5元/kg上涨至16.87元/kg， 涨幅达183%；2010年4月至2011年6月，全国生猪价格由9.53元/kg上涨至17.54元/kg，涨幅达85%。
而2010上半年，生猪价格快速下滑，由1月份的12.09元/kg迅速下跌为6月份的9.64元/kg，使得全国生猪养殖平均亏损面达到60%；2013年末到2014年4月受供过于求的生猪市场和消费下滑影响，生猪价格又大幅下跌，由2013年底的14.9元/kg跌到10.0元/kg以下，每头猪亏损达300多元。
生猪价格的剧烈波动，对生猪产业乃至整个经济社会发展都产生了巨大影响。生猪价格下跌养殖户亏损严重，而生猪价格的快速上涨则使得居民消费水平大幅下降，对农村居民及城市贫困人口日常生活带来显著影响。
生猪养殖规模化发展面临人才瓶颈和劳动力短缺
近年来我国城市经济的快速发展，吸收了大量农村劳动力进入二三产业，劳动力短缺对生猪产业的影响己经显现。由于养猪的工作环境较差，其从业人员的社会地位也较低，加上规模化养猪对防疫要求很高，需长时间的隔离，生活单调乏味，许多人不愿从事此行业，导致养殖企业招工难，养殖企业缺乏有能力、有技术、肯吃苦的熟练饲养人员，而具备较全面养殖技术和实际操作经验的规模养殖场场长更少。这对生猪产业的稳定和长期发展十分不利。
重大动物疫病成为制约我国生猪业发展的障碍
随着生产发展，规模化发展加快，规模养殖密度增大，饲养环境变差，防疫不严也容易滋生疫病，一旦疫病暴发，传播速度快，传播面大，造成损失巨大。近年来，我国生猪疫病呈多发态势，如猪流感、猪蓝耳病等各类重大疫病在我国时有发生，一方面会造成生产能力下降和巨大的经济损失，影响养殖户的积极性。另一方面，还会使消费者产生恐慌而减少猪肉消费意愿。同时也影响了我国猪肉的出口贸易。
生态环境对生猪业发展的制约日益突出
随着养猪场数量的增加和养殖规模的扩大，集约化养殖带来的环境污染问题日益严重，国家关于畜禽养殖业环保政策的出台，一方面使养殖污染得到控制，环境状况得到好转，但另一方面制约了畜牧业的发展。养猪业环保法律法规客观上提高了进入养殖业的门槛，也大大提高了规模养殖场的建设成本和运行成本。
