随着生物技术的发展，微生物资源得到不断地开发。在饲料领域也得到了高度认可和广泛应用，形成了以基因工程、蛋白质工程、发酵工程等高新技术为手段，利用微生物发酵工程开发的新型饲料添加剂行业；以微生物发酵技术同传统固体发酵技术相结合形成的固体发酵饲料行业。达到节约粮食、减缓人畜争粮、为饲料开源节流的目的。
添加剂领域
在添加剂领域，围绕微生物资源，形成了34种动物益生菌菌种的微生态制剂和饲料发酵剂；围绕微生物液体发酵的产物分离和纯化，形成了酶制剂、部分维生素和氨基酸添加剂；并在此基础上形成了抗菌肽、功能性寡糖、有机微量元素、生物有机酸等添加剂门类。
饲料资源开发领域
在饲料资源开发领域，围绕微生物的固体发酵技术，形成了发酵豆粕、发酵棉籽蛋白、酿酒酵母培养物、发酵某果渣、酿酒酵母发酵白酒糟等新型的饲料原料。这两方面在动物养殖上发挥了巨大的作用，各种添加剂改善了动物的营养平衡，提高了饲料的利用率，提升了动物的生产潜力，改善了动物的健康状况；新型饲料资源可大幅度提升农副产品的饲用价值、降低饲料成本、改善动物产品品质。
另外，微生物饲料相关技术形成的产品可降低畜禽粪氮、粪磷的排放量，从而大幅度减轻养殖业造成的环境污染。通过在饲料中应用微生物资源和技术，对摆脱对抗生素的依赖，获得优质、安全的动物产品具有重要意义。目前，国内已有几百家企业专门从事微生物相关的饲料添加剂和微生物发酵饲料的生产。
我国在生物饲料领域虽然取得了一些成绩，但与国外相比，生物饲料的研究与产业化起步较晚。许多关键添加剂的生产还处于仿制水平或严重依赖国外技术，缺乏自主知识产权。某些领域与国外先进水平还存在一定的差距。目前，需要解决以下几个方面的问题：
1、建立微生物饲料产品相关基因资源的高通量筛选技术和快速有效的功能评估系统，获得一批有自主知识产权、有应用价值的新物种和基因资源；
2、构建基因工程技术平台，通过对天然蛋白质的基因进行定向改造，创造出新的具备优良特性的蛋白质分子，从而提高蛋白表达量和活性、降低生产成本、实现规模化廉价生产；
3、建立微生物饲料发酵工程技术平台，利用发酵与酶解相结合，开发高效、稳定、实用的微生物产品加工技术，并建立相应的标准等。
预计到2025年，微生物饲料产品市场额将达到200亿美元/年，并且生产技术和应用技术水平将大幅度提高并标准化。微生物饲料产品的大量应用，将终结养殖业的抗生素、化学添加剂时代。
