一、疫苗质量不合格
疫苗中免疫成分的高低是疫苗能否达到良好免疫效果的决定性因素。疫苗质量不合格或已过期失效；疫苗因运输、保存不当或疫苗取出后在免疫接种前受到日光的直接照射，或取出时间过长，或疫苗稀释后未在规定时间内用完，都会影响疫苗的效果。
二、免疫程序不科学
盲目推迟或提前免疫，或2次免疫与3次免疫之间间隔时间太长。目前，有些肉鸡养殖场（户）进行免疫时只是凭经验或跟着别人执行着一成不变的免疫程序，没有根据实际情况制定切合实际的科学的免疫程序，因而容易造成免疫失败。
三、接种方法不当
疫苗稀释不当，没有按疫苗要求规定浓度进行稀释，或将不同疫苗的稀释液拿来做稀释等，这样会破坏或降低疫苗的效价与免疫原性。同时进行两种以上的疫苗接种，不同的疫苗有不同的特异性，会引起免疫抑制，导致免疫失败。
四、母源抗体干扰
母源抗体对初生畜禽有保护作用，但也会影响畜禽的免疫效果，即母源抗体的双重性。因此，在给畜禽使用高质量的疫苗时，能否起良好的免疫效果与母源抗体滴度有关。当母源抗体滴度高时，实施免疫接种，疫苗病毒会被母源抗体中和而不起保护作用。若母源抗体过高反而干扰了后天免疫，不产生应有的免疫应答。
五、饲养管理水平差
消毒卫生制度不健全，肉鸡舍及周围环境中存在大量的病原微生物，在用疫苗期间鸡群已受到病毒或细菌的感染，这些都会影响疫苗的效果，导致免疫失败。饲喂霉变的饲料或垫料发霉，其霉菌毒素能使胸腺、法氏囊萎缩，毒害巨噬细胞而使其不能吞噬病原微生物，从而引起严重的免疫抑制。
六、应激因素频繁
生产中各种应激因素如断喙、转群、变换饲料、突然断电、断水、断料、气候反常、通风不良、连续阴雨、高温高湿、温度不均、寒潮袭击等，均会导致淋巴细胞转化率吞噬能力下降。因此，在应激期间接种疫苗，则不能取得立竿见影的免疫效果，表现为抗体水平低下和细胞免疫应答减弱。
