众所周知，病害是病原、虾体、环境三者相互作用的结果。有效的水体消毒，是对虾健康养殖的第一道关口。不同的环节，需要相适应的消毒措施，才能达到最佳消毒效果，下文简介一些消毒知识：
一、清塘消毒
大家都知道，在放苗前需要清塘消毒，此项工作非常重要。那么对于清塘消毒，什么时间下消毒药比较好？我们在确定用药时间的时候，先要明确我们消毒的载体和目的。清塘，就是要尽可能杀灭池塘底部的有害微生物，载体是底泥。对于土池来说，病原大量分布在底泥中，底泥中的还原性成分对消毒剂的作用本身就有一定缓冲、中和作用，这时候就要求消毒剂的作用时间要较长，或者说有效浓度时间要足够长，因此，我们建议在傍晚时间段下消毒剂，因为对常用的生石灰、漂白粉、强力精等大部分消毒剂来说，都是在温度高的时候释放快，温度低时候释放慢。选择温度较低的傍晚时间段下消毒剂，可以让消毒剂的有效浓度维持更长，达到持久渗透到池底深部，穿透力更强，更大程度杀灭底部有害菌。对于高位池或者水泥池来说，差异性不大，因为其底部淤泥少，供病菌躲藏的地方不是很多。
二、进水消毒
进水后，可进行水体消毒，俗称放苗前的二次消毒，这时候消毒浓度可稍高一些，这时候我们的作用载体是水体，目的是把水体中的病菌尽可能杀灭，此阶段较多使用的是二氧化氯、强氯精等，建议在晴天的上午使用。因为，在晴天上午使用，消毒剂的释放会随着水温的增高而加快，在下午的时候浓度可达到高值，有效快速杀灭病菌，同时消毒剂也会较快释放完全，在水体中残留时间缩短，因为，此次消毒的水体是我们接下来要养殖用的水体，必须关注残留的问题。
三、养殖过程
虾苗在池塘中的养殖，手法因人而异，整个养殖过程都不消毒的也大有人在，这与当地水质、土质情况有关，不消毒的需要保持水体有益菌的在养殖载体中的浓度，通过生态位竞争来有效抑制有害菌的繁殖，这里不作讨论。但在事实的养殖环境中，大部分的水源条件并不理想，有害微生物浓度较大，危害对虾养殖。此时，可在放苗后5-7天进行一次消毒，此时消毒是针对虾苗自带病原。大家都知道，即使是大厂家的苗种，也只能保证出厂的虾苗不带特定病毒，以及病菌浓度在可控范围内，由于海区的污染等情况，是没有办法完全杜绝携带。而虾苗场的条件大部分都比养殖场要好，可控性远远优于养殖池塘，这也解释了为什么在虾苗场能控制的病害，到了养殖池塘就很难把控。所以这时候需要进行一次消毒，消毒剂可选用碘制剂、二溴海因等比较温和些的消毒剂，消毒时间选在傍晚，然后第二天上午即可进行解毒、补钙、补菌等工作，如果偏向针对弧菌，可以选择过硫酸氢钾。
在整个养殖期间，是否需要定期消毒？多长时间消毒一次？刚才有提到，不消毒也有很多人养殖成功，但那需要良好的自身条件。如果附近养殖环境普遍差，水质条件不好，周围发病率高，就需要定期进行消毒。这里说的定期，并不一定是固定的10天，或者就15天，准时去消毒，而是要灵活掌握时间。具体而言，是选择在10-15天中，选择天气以及水质情况较好的条件下进行消毒。消毒时间需要选在晴天的傍晚，消毒剂的选择也尽量选择对藻类杀伤较小的一点的消毒剂，避免由于消毒而造成的水质突变、缺氧。在消毒中，需要注意的一点是，消毒是预防措施，需要在虾体和水质环境都良好的情况下进行，在虾体质弱、水质条件不好的时候反而需要慎重。在定期消毒中，消毒剂的选择最好进行更换，如果使用的和上一次同样的消毒剂，浓度可稍微加大。
四、雨后消毒
养殖白虾的过程中，有一个发病的高峰点，那就是暴雨之后，无论什么季节，大雨都能引起大面积的发病。这是因为，降雨除了会造成水质突变，环境因子的差异导致虾体应激，还会带入大量外来有害菌。那么针对雨水，该选择什么时候消毒？此时消毒建议选择在雨后2-3天，选择气候稳定的傍晚进行消毒。为什么选择这时候，因为在下雨过程中，虾其实在遭受着水温变化、水质变化等影响，虾已经处于应激状态，体质状态差，不适合消毒。在雨后的2-3天，虾体质逐渐恢复，水质条件逐渐好转情况下（需要雨后立刻进行调理水质）进行消毒，可将水质的变化、虾的应激和伤害降到最低。同时，雨后，病菌也是一个繁殖的上升期，此时的消毒恰好能把握时机，抑制病菌的繁殖。
