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几种口蹄疫病毒检测方法对比

发布时间:2014-04-02 16:03    作者:yizhiinfo    来源:畜牧人才网    查看:

曹建新 齐莹莹 王虹 赵勇
天津市动物疫病预防控制中心
天津市动物卫生监督所

 

    口蹄疫的实验室诊断主要是病原学诊断和抗体检测两个方面, 口蹄疫常规鉴定内容是抗原鉴定和核酸鉴定, 核酸鉴定是近年发展起来的较新的鉴定技术, 其中最常用的是 RT - PCR 技术。该技术的最大优点是敏感、 快速和可检样品广泛, 经序列测定后, 还可明确被检病毒的血清型和基因型。传统的核酸分离技术包含沉淀、 离心等过程, 这些纯化方法的步骤繁杂、 费时、 收率低, 且需接触有毒试剂, 很难实现自动化操作。而采用核酸磁珠分选纯化系统就能很好地克服这些缺点, 实现样品的快速、高效制备, 是未来核酸纯化方法发展的一个重要方向。笔者根据在实验室批量检测口蹄疫工作的需要,对几种口蹄疫病毒检测方法进行了比较, 以期为批量样品检测试剂的选择提供参考。


1材料
1. 1检测试剂
    口蹄疫病毒通用型实时荧光 RT - PCR 检测试剂盒, 购自深圳太太基因工程有限公司;口蹄疫 RT -PCR 试剂盒, 购自中国农科院兰州兽医研究所;口蹄疫病毒柱式提取 RT - PCR 试剂盒, 购自北京世纪元亨动物防疫技术有限公司;核酸磁珠分选纯化系统,购自天津市诺尔斯医疗用品有限公司。
1. 2主要仪器设备
    CFD - 3200 荧光 PCR 仪, MJ Research 公司生产;UNOⅡPCR 扩增仪, 美国 Whatman 公司生产;MagMAXTMExpress -24 型磁珠处理仪, Invitrogen 公司生产。


2方法
样品来自天津市郊区某生猪屠宰场, 淋巴结 10份、 猪肉 10 份。全部试验均按试剂盒说明书进行。
3试验原理
3. 1口蹄疫病毒实时荧光 RT - PCR 检测
    利用离心柱内硅基质膜提取样品总 RNA, 在高效反转录酶的作用下, 以 RNA 为模板, 以引物为起点合成与 RNA 模板互补的 cDNA 链。在热启动 Taq 酶的作用下, 经高温变性、 中温退火及延伸的循环, 使特异 DNA 片段的拷贝数放大一倍, 经荧光素标记的探针与扩增的 DNA 杂交, 利用 Taq 聚合酶的 5'→3'外切活性, 使荧光探针的报告基团与淬灭基团分离, 发出特异性荧光信号, 利用荧光 PCR 仪检测特异性荧光信号, 根据样品 Ct 值的大小及扩增曲线的形成情况判定结果。
3. 2口蹄疫 RT - PCR 检测
    将RNA 的反转录(RT)和 cDNA 的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术, 首先经反转录酶的作用从RNA 合成 cDNA, 再以 cDNA 为模板, 扩增合成目的片段。
3. 3口蹄疫病毒柱式提取 RT-PCR
    采用离心柱内硅基质膜提取系统和混合酶系统,可以快速有效地进行 RT - PCR 检测。
3. 4核酸磁珠分选纯化系统
    通过特制的磁棒吸附、 转移和释放磁珠, 从而实现磁珠/样品的转移, 实现自动提取纯化操作。
4检测结果
4. 1四种试剂盒的重复性试验
    用同一批样品、 同一批号的试剂盒、 同一个操作者进行多次试验, 观察其重复性。试验结果表明:无明显差异。
4. 2四种试剂盒的特异性和敏感性
用已知背景的样品检测, 观察其特异性和敏感性。试验结果表明:荧光 PCR 的灵敏度高, 比普通RT - PCR 试剂盒高 10 ~ 100 倍;核酸磁珠分选纯化系统核酸纯度可达到 95%以上。
4. 3四种试剂盒检测时间的比较
用同一批样品、 四种不同试剂盒、 同一个操作者进行试验。结果见表 1。试验结果表明:柱式提取 RT - PCR 比普通 RT -PCR少2.5h。
4. 4四种不同检测方法优缺点的比较(见表 2)


5结论
    通过对四种不同口蹄疫检测方法的比较发现, 各种方法各有优缺点, 针对实际批量检测工作的需要,选择一种操作简便、 快速、 更加环保安全、 特异性强、灵敏度高的试剂是非常重要的。

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