杭州市农业科学研究院 （Hangzhou Academy of Agricultural Sciences）成立于2004年3月，是根据市委、市政府整合农业科技资源的要求，撤消原4个农口研究所，重新组建的综合性农业科研、推广机构，为市政府直属事业单位。

　　杭州市农业科学研究院核定编制182人，现有职工中科技人员比例达到78%。全院下设水产所、蔬菜所、茶叶所、农作物（生态）所、生物技术所、园艺所、畜牧所、农产品加工所8个研究所、信息中心、实验中心2个中心、党政办、科技处、综合处3个管理处室和国家级三角鲂原种场。其主要职能是：承担农业开发性、应用性研究和开展农业先进适用技术的引进、示范和推广任务，受委托开展农产品、农业投入品和产地环境的相关检测工作。