为加快改善洞庭湖生态环境，推动生态文明建设，湖南省制订洞庭湖生态环境专项整治三年行动计划(2018—2020年)。其中农业面源污染防治方面：规模养殖场粪污处理设施装备配套率达到95%以上，化肥利用率提高5个百分点，秸秆综合利用率达到85%以上。
全面推进农业面源污染防治
1、加强畜禽养殖污染防治。
稳步推进畜禽养殖污染整治行动，严格执行畜禽养殖分区管理制度，禁养区规模畜禽养殖场全部关停退养或搬迁。加快推进畜禽适度规模养殖，到2020年，湖区畜禽规模养殖比重达50%以上。规模养殖场粪污处理设施装备配套率达95%以上(大型规模养殖场达100%)，依法关停未按期安装粪污处理设施和未实现达标排放的规模养殖场。对新建和扩改建畜禽养殖场，严格执行环境影响评价制度，坚决做到主体工程与养殖废弃物处理设施同时设计、同时施工、同时投入使用。
支持市、县市区根据辐射半径，在密集养殖区布局建设一批粪污集中处理设施。优先支持洞庭湖县市区纳入国家畜禽养殖废弃物资源化利用整县推进试点。支持在粪污集中处理设施周边，布局建设循环农业基地，促进农牧结合，推进畜禽养殖废弃物资源化利用。
构建有机肥替代化肥的组织方式、政策体系和长效机制，实施有机肥生产、贮运和使用财政性奖补，着力打通养殖废弃物资源化利用的有效通道，利用率提高到75%以上。到2018年，基本建成覆盖湖区的病死畜禽无害化收集处理体系。
2、推进渔业生态健康养殖。
修订《洞庭湖区养殖水域滩涂规划》，全面规范河流、湖泊、水库等天然水域的水产养殖行为，禁止天然水域投饵投肥养殖，严格控制湖泊珍珠养殖。加快推进河湖矮围网围清理整治行动，矮围网围和饮用水源一级保护区的养殖网箱网拦全部清理拆除。加快推广稻鱼综合种养技术模式，洞庭湖区稻鱼综合种养面积每年新增20万亩。升级改造洞庭湖区70万亩精养池塘，实现池塘渔业用水循环利用、达标排放。
